東京農工大學專業

東京農工大學現在設有2所本科學院，6所研究生院。

本科學院

東京農工大學本科設有兩所學院，分別是農學部和工學部。

農學部由5個學科組成，分別是生物生產學科、應用生物學科、環境資源學科、地球生態系統學科和獸醫學科。農學部要求學生通過對農業、生物和生態科學的學習，了解農學、生命科學、環境科學和獸醫學等領域的問題，為營造可持續發展的社會做出貢獻。

工學部由8個學科組成，分別是生命工程學科、應用分子化學科、有機材料化學科、系統化學工學科、系統機械學工學科、系統物理工學科、電器電子工學科和信息工學科。工學部教授工程領域的知識和技術，培養學生分析和解決問題的能力，使其具有良好科學素質和專業工學知識。

研究生院

6所研究生院分別是：工學府、農學府、生物體系應用科學府、聯合農學研究科、技術經營研究科和岐阜大學研究生院聯合獸醫學研究科。

工學府開設了碩士課程和博士課程，目的是培養具有卓越能力的工學領域技術人員和研究人員。工學是東京農工大學的優勢學科，與企業和其他機構的合作研究項目數量眾多，在報紙媒體實施的科研能力調查排行榜中經常位列日本的國立大學前茅。

農學府開設了2年制碩士課程，對日趨嚴重的全球性糧食、資源問題、環境與公害問題和人口問題進行研究，讓學生具有自主的教育研究能力。

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