熊本大學（日文平假名：くまもとだいがく；英文：Kumamoto University），位于日本九州熊本市的一所研究型國立大學，日本超級國際化大學計劃成員。

該校起源于寶歷年間的1756年7月，由熊本藩藩主細川重賢建立的藥學院“蕃滋園”，距今已有260多年歷史。其前身熊本醫科大學為當時日本最頂級大學群”舊官立大學“（七帝大，六醫大，二文理科大，二工科大，二商科大）中“舊六醫大”的一員。

熊本大學向來以其出色的科研實力聞名國際，由該校満屋裕明教授于1985年開發出的世界最初的HIV治療藥AZT。2007年被授予”紫綬褒章“，2015年被授予“日本學士院獎”，并多次被提名為諾貝爾獎候補。此外該校先進鎂合金國際研究中心的河村能人教授開發出了世界唯一的不易燃鎂合金“KUMADAI不燃鎂合金”，并以此于2017年獲得”紫綬褒章“。

諾貝爾生理或醫學獎獲得者山中伸彌教授為該校發生醫學研究中心的客員教授。池田勇人、佐藤榮作兩位日本首相早年皆就讀于熊本第五高等學校（后并入熊本大學）。在1974年佐藤榮作獲諾貝爾和平獎。

2020年QS世界大學排名，位列531-540區間。2021年QS世界大學排名，位列561-570區間。

熊本大學學校排名

2016CWUR世界大學排名中位居世界第458位，日本國內第18位。

2017QS世界大學學科排名中，其藥學與藥理學（Pharmacy & Pharmacology）專業位居世界151-200位，并列日本國內第8位。生命科學與醫學（Life Sciences and Medicine）專業位居世界第351位，日本國內第16位。

2019QS世界大學排名中位居第500位，日本國內第18位。

2021QS世界大學排名，位列561-570區間。

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